中国科学院理论物理所郝柏林院士及其领导的科研小组最近采用全新的方法，就SARS病毒不同毒株之间的亲缘关系，以及与其它冠状病毒的进化关系给出了新的结论。他们首先选取6个完整的SARS基因组和14个已知的冠状病毒的完全基因组(与SARS同属Nidovirales科)，利用“组分矢量(k-字串)”方法探讨了这些基因之间的进化关系。从他们得到的进化树可以看出，在全基因组的层次上，选定的6个SARS毒株相互之间关系较近(在进化树上形成单群)，而与已知的冠状病毒距离比较远，这与目前公认的SARS是冠状病毒属的独立种群的结论相一致。另一方面，由于SARS病毒各个毒株之间的差异太小，如此构建的进化树并不足以区别出SARS病毒之间的亲缘关系。为进一步讨论这一课题，他们又在传统的距离矩阵方法基础之上，使用“超度规”算法得到了具有精细结构的带根亲缘树，这与先前他人得到的无树根相比无疑是一个更有意义的结果。他们还将这个分子层次的亲缘树与各个病毒毒株在临床上表现的亲疏关系做了对比，在毒株的分类、病毒的传染途径等问题上得到了可比较的结论。这些探讨无疑将对SARS病毒的起源和进化变异等研究提供新的启示。相关的学术论文将在最近一期《中国科学》英文版《Science in China, series C》发表。
