非典”过后，广州市加快发展卫生事业，着力建立长效的防治机制，重点加强疫情预防控制体系、医疗救治体系和卫生监督体系的建设，完善公共卫生事件应急处理机制，做好重点部位和重点环节的防控工作。
广州市政府决定投资３．５亿元在白云区新建一个国内一流的疾病预防控制中心，建筑面积达40000平方米；还将建设一间拥有８００个床位、建筑面积达９３０００平方米、总投资约５亿元的现代化传染病院，计划３年建成；此外，还要投资实施广州医学院的改造工程和建造临床教学楼。广州市还决定在全市二级以上医院建立相对独立的发热门诊和病人留观区；建立覆盖全市各医疗卫生单位的公共卫生信息网络和平台，重点建设覆盖整个城市人口和农村地区的疾病预防控制网络。
