1997年末,日本的一个病毒研究小组应用分子生物学技术从一名输血后原因不明肝炎病人血清中克隆到500硷基对(base pairs,bp)的病毒样DNA片段,命名为N22克隆,并确定为一种新的DNA病毒,因此按病人姓氏缩写命名为TT病毒。目前的研究表明,TTV基因组为3852bp的单股环状负链DNA分子,是一种大小约30-32nm的无包膜球形病毒颗粒。TTV基因组由编码区和非编码区组成。非编码区核苷酸序列相对保守,而编码区核苷酸和氨基酸序列均高度变异,其编码病毒的衣壳等结构蛋白,最早发现的N22克隆位于编码区中。
TTV的一个重要特性是基因组核酸序列高度变异,这种现象作为DNA病毒是十分罕见的。目前,根据核酸序列差异对TTV进行基因分型,但方法和命名尚不统一。早期分型工作是依据N22区(220bp)的核苷酸序列间的差异进行的,称为N22分型法。因该区域核苷酸序列较短且高度变异,故各家报道分型结果不完全一致。随着研究的深入,利用TTV ORF1全序列(约2200 bp)进行分型,可将当时报道的TTV变异株分为4个基因群23种基因型。由于后者较N22分型法能更好地反映TTV高度异质性的特点,因此是目前较实用的一种分型方法。随后,在此基础上我们首次报道了一个新基因群,第5基因群以及11种新的基因型,故将TTV的基因分型增加到5个基因群,共计34个基因型。
TTV是迄今发现的第一个感染人类的单股环状DNA病毒,其分类学地位尚不明确。在这个庞大的病毒群体中,分离株间核酸异质性超过40%,这种差异已超过国际病毒分类命名委员会划分病毒“属”(genus)的范围,但其基本的基因结构和转录功能却十分保守。
TTV的一个重要特性是基因组核酸序列高度变异,这种现象作为DNA病毒是十分罕见的。目前,根据核酸序列差异对TTV进行基因分型,但方法和命名尚不统一。早期分型工作是依据N22区(220bp)的核苷酸序列间的差异进行的,称为N22分型法。因该区域核苷酸序列较短且高度变异,故各家报道分型结果不完全一致。随着研究的深入,利用TTV ORF1全序列(约2200 bp)进行分型,可将当时报道的TTV变异株分为4个基因群23种基因型。由于后者较N22分型法能更好地反映TTV高度异质性的特点,因此是目前较实用的一种分型方法。随后,在此基础上我们首次报道了一个新基因群,第5基因群以及11种新的基因型,故将TTV的基因分型增加到5个基因群,共计34个基因型。
TTV是迄今发现的第一个感染人类的单股环状DNA病毒,其分类学地位尚不明确。在这个庞大的病毒群体中,分离株间核酸异质性超过40%,这种差异已超过国际病毒分类命名委员会划分病毒“属”(genus)的范围,但其基本的基因结构和转录功能却十分保守。