ＴＴＶ在机体内含量较低，并且病毒高变异性，目前ＴＴＶ的检测主要依靠分子生物学技术－ＰＣＲ方法进行。研究早期，利用当时有限的Ｎ２２区核酸序列建立了Ｎ２２ ＰＣＲ法检测人群中ＴＴＶ的感染情况，测得的各国感染率介于２％－３０％之间。随着报道序列的增加，发现ＴＴＶ非编码区（ｕｎｔｒａｎｓｌａｔｅｄ ｒｅｇｉｏｎＵＴＲ）的某些区域核苷酸序列非常保守。因此利用ＵＴＲ区中高度保守的序列建立了ＵＴＲ ＰＣＲ，发现世界各地健康人群的感染率介于８０％－１００％，此检出率大大高于用Ｎ２２ ＰＣＲ所得的结果。两种方法所得的差异主要与ＰＣＲ引物的位置有关。Ｎ２２ ＰＣＲ引物位于核酸序列高度变异的编码区中，有一些变异株用该法无法检测到，因此该检测结果不能反映人群中实际的感染水平。ＵＴＲ ＰＣＲ则建立于核酸序列高度保守的ＵＴＲ内，此方法可检测目前已知不同的ＴＴＶ变异株，所以ＰＣＲ引物的位置对其检测结果影响极大。ＵＴＲ ＰＣＲ法的建立是ＴＴＶ研究中很重要的一个进展，这使人们对ＴＴＶ的流行病学特点、传播途径及致病性等方面有了新的了解和认识。
